Quán Toan không có mỏ khoáng sản. Phía đông tiếp giáp với sông Cửa Cấm là một nhánh của sông Cấm thông ra biển Đông với nhiều loại hải sản có giá trị kinh tế cao. Các bãi triều gần sông Cửa Cấm không những thuận lợi cho khai thác thủy  hải sản  mà còn sử dụng cho nuôi trồng thủy sản mặn lợ với các sản phẩm giá trị.

Tài nguyên đất

Quán Toan có khoảng 244 hecta đất hình thành chủ yếu từ phù sa hệ thống sông Thái Bình. Hầu hết là đấ chua và chua mặn với địa hình xen kẽ giữa các giải  đất thấp và cao. Biến động khí hậu ảnh hưởng tiêu cực tới đất, thổ nhưỡng và thực vật, gây thêm khó khăn cho sản xuất nông nghiệp, đặc biệt là trồng trọt.

Tài nguyên nước mặt

Tài nguyên nước mặt ở Quán Toan khá đa dạng và phong phú, gồm nước ngọt, nước lợ và nước biển.  Tổng chiều dài các con sông chảy qua Quán Toan khoảng 1 km, mật độ trung bình 0,6-0,8 km/km².